У меня, увы, нет Микротика и проверить это я не могу. Но мне кажется, что "сертификат" и файл конфигурации .ovpn - это разные вещи. Наш конфигурационный файл содержит несколько сертификатов и другие данные, поэтому вряд ли. Нужно читать доку от Микротика - это вообще настройки клиента OpenVPN или какого-то другого VPN протокола?
Красненькое - не всегда ошибка именно подключения (просто пинг не ходит, надо в чекере переделать кое-что).
Но с другой стороны, вы говорите, что сейчас нет коннекта именно по L2TP без IPsec?